AAV 간·폐·근육에서 자주 사용되는 프로모터 정리

AAV의 조직 특이적 발현은 혈청형 하나만으로 결정되지 않습니다.

혈청형은 주로 “어디까지 전달될 수 있는가”에 영향을 주고,
프로모터는 “어떤 세포에서 발현되는가”를 결정하는 중요한 요소입니다.

간, 폐, 근육 등을 표적으로 하는 AAV 연구에서는 프로모터 선택에 따라 목적 유전자의 발현 범위와 발현 수준이 달라질 수 있습니다.

이 글에서는 프로모터의 작용 기전을 길게 설명하기보다는, 연구에서 자주 사용되는 프로모터를 중심으로 정리합니다.

AAV 간·폐·근육 연구에서 사용되는 대표적인 조직 및 세포 특이적 프로모터를 한눈에 정리했습니다.

간에서 자주 사용되는 AAV 프로모터

AAV를 이용한 간 표적 연구에서는 TBG, hAAT, HCR/hAAT, LP1, HLP 등이 대표적인 프로모터 후보로 사용됩니다.

다만 동일한 프로모터 이름이라도 연구에 따라 사용되는 서열의 길이나 인핸서 조합이 다를 수 있습니다. 따라서 실제 AAV 벡터를 설계할 때는 프로모터 이름만 확인하기보다는 사용하려는 구체적인 서열과 참고 문헌을 함께 확인하는 것이 중요합니다.

폐·기도에서 자주 사용되는 AAV 프로모터

폐를 표적으로 하는 AAV 연구에서는 단순히 “폐 특이적 프로모터”를 선택하기보다는 어떤 폐 세포를 표적으로 하는지를 먼저 결정하는 것이 중요합니다.

예를 들면 다음과 같습니다.

• SFTPC / SP-C：폐포 II형(AT2) 세포 관련 연구
• SCGB1A1 / CC10：Club 세포 및 기도 상피 연구
• FOXJ1：섬모 상피세포 연구
• KRT5：기도 기저세포 관련 연구

즉, 연구 대상 세포에 따라 적합한 프로모터 후보가 달라질 수 있습니다.

근육에서 자주 사용되는 AAV 프로모터

근육을 표적으로 하는 AAV 연구에서는 MCK/CKM 계열 프로모터가 널리 사용되며, CK6, CK8, tMCK 등 다양한 구성이 연구되어 왔습니다.

또한 MHCK7은 MCK 관련 조절 서열과 α-MHC 관련 서열을 조합한 키메라 프로모터로, 골격근과 심근을 함께 고려하는 연구에서 사용됩니다.

만 AAV의 조직 특이적 발현은 프로모터 하나만으로 결정되지 않습니다.

실제 벡터 설계에서는 다음 요소를 함께 고려해야 합니다.

표적 조직 → 표적 세포 → 프로모터 → AAV 혈청형 → 투여 경로 → 발현 수준

또한 AAV는 탑재할 수 있는 게놈 크기에 제한이 있기 때문에 프로모터의 크기 역시 전체 벡터 설계에서 고려해야 합니다.

정리

AAV의 조직 특이적 발현을 설계할 때는 단순히 “어떤 프로모터를 사용할 것인가”만 보는 것이 아니라, 어떤 세포에서 어느 정도의 발현을 얻고자 하는지를 먼저 명확히 하는 것이 중요합니다.

간에서는 TBG, hAAT, HCR/hAAT, LP1, HLP, 폐에서는 SFTPC, SCGB1A1, FOXJ1, 근육에서는 MCK, CK6, CK8, tMCK, MHCK7, Desmin 등이 대표적인 후보로 고려될 수 있습니다.

실제 AAV 벡터 설계에서는 표적 세포, 동물종, 투여 경로, 프로모터 서열 및 GOI 크기 등을 종합적으로 검토하는 것이 좋습니다.

면책사항: 본 내용은 공개 문헌 및 자료를 바탕으로 AAV에서 사용되는 조직 및 세포 특이적 프로모터를 정리한 것입니다. 프로모터의 서열, 길이, 인핸서 구성, 동물종 및 실험 조건에 따라 실제 발현 특성은 달라질 수 있습니다. 구체적인 벡터 설계에 적용하기 전에는 관련 원문 논문과 실제 사용하려는 프로모터 서열을 확인하시기 바랍니다.