AAV 대조 바이러스에는 어떤 것이 있나요?

AAV 실험에서는 시스템이 정상적으로 작동하는지 확인하고, 비특이적 신호를 배제하며, 전반적인 전염 효율을 평가하기 위해 다양한 대조 바이러스(Control AAV) 를 사용합니다. 대표적인 AAV 대조 바이러스는 다음과 같습니다.

1. 음성 대조(Negative Control)

① AAV-Empty / AAV-Null (빈 벡터 AAV)

• ITR만 포함하고 발현 카세트가 없음

• 바이러스 자체의 영향과 목적 유전자의 효과를 구분하는 데 사용

② 기능이 없는 리포터 AAV (예: AAV-ΔGFP)

• 핵심 서열을 제거해 발현되지 않도록 구성

• 배경 형광 또는 비특이적 신호 확인용

③ 열불활성화된 AAV (Heat-inactivated AAV)

• 가열 처리해 감염 능력이 없는 바이러스

• “바이러스 입자 자체”의 영향을 평가할 때 사용

2. 양성 대조(Positive Control)

① AAV-GFP / AAV-mCherry / AAV-tdTomato

• 가장 널리 사용되는 양성 대조

• 패키징 성공 여부, 유효한 역가, 감염 효율 확인

• in vitro / in vivo 실험 모두에 사용 가능

② AAV-Luc (루시페레이스 발현 AAV)

• 정량 분석 가능

• 생체 발광(BLI) 영상, 기능적 역가 테스트에 적합

3. 조직 특이적 프로모터 대조

조직 특이적 프로모터를 사용하는 경우, 해당 프로모터의 정상 발현을 검증하기 위해 리포터 AAV를 사용합니다.

① AAV-CaMKIIa-GFP / AAV-hSyn-GFP (신경세포 특이)

② AAV-GFAP-GFP (성상교세포 특이)

③ AAV-MCK-GFP (근육 특이)

프로모터의 조직 특이성과 발현 패턴을 확인할 수 있습니다.

4. 혈청형(Serotype) 대조

감염력 또는 조직 친화성을 비교할 때 다음과 같은 GFP 대조 세트를 사용합니다.

• AAV2-GFP

• AAV8-GFP

• AAV9-GFP

• AAV-PHP.eB-GFP

• AAV-DJ-GFP 등

동일 발현 카세트를 사용하여 혈청형 간 차이를 평가함.

5. CRISPR 실험용 대조 AAV

① AAV-Cas9 only (gRNA 없음)

• Cas9 단독 발현에 의한 배경 효과 평가

② AAV-scramble gRNA

• 비특이적 gRNA를 사용한 음성 대조

③ AAV-gRNA Targeting Known Gene

• 이미 효과가 검증된 유전자를 타깃하는 양성 대조