연구용 AAV는 정제 없이 사용해도 되는가

가능은 하지만, 일반적으로는 권장되지 않습니다.

핵심 요약

• 시험관 내(in vitro) 실험, 예비 검토, 요구 수준이 높지 않은 실험에서는 비정제 AAV의 조제액을 사용하여 초기 탐색을 수행하는 경우가 있습니다.
• 그러나 동물실험, 일차세포, 신경세포, 줄기세포, 정량 비교, 논문용 데이터 확보의 경우에는 정제를 강력히 권장합니다.

비정제 AAV의 주요 문제점

1. 불순물이 많습니다
   숙주세포 유래 단백질, 핵산, 배지 성분, 형질도입/전달 잔여물 등이 포함될 수 있습니다.
2. 독성 및 배경 신호가 증가할 수 있습니다
   세포 상태에 영향을 주어 결과 해석이 어려워질 수 있습니다.
3. 역가 측정이 부정확하고 재현성이 떨어질 수 있습니다
   동일한 양을 처리하더라도 실제 유효 바이러스량이 일치하지 않을 수 있습니다.
4. in vivo에서는 위험성이 더 큽니다
   염증 반응이나 면역 반응을 유발하기 쉬우며, 조직 특이성 및 안전성에도 영향을 줄 수 있습니다.
5. 논문 투고 및 심사 과정에서 불리할 수 있습니다
   많은 심사자는 벡터의 순도, 역가, 품질관리를 중요하게 봅니다.

제한적으로 사용 가능한 경우

일반적으로 다음과 같은 경우에 한해 고려될 수 있습니다:

• 벡터가 발현되는지 여부를 신속하게 확인하는 경우
• 비교적 다루기 쉬운 세포주에서의 초기 스크리닝
• 정밀한 정량보다는 유무 또는 대략적인 경향만 확인하는 경우

비정제를 권장하지 않는 경우

• 마우스, 랫드 등 동물에 대한 in vivo 주입
• 일차세포, iPSC, 신경세포 등 민감한 시스템
• 용량-반응 시험 또는 서로 다른 construct 간 비교
• 장기 발현 또는 기능 실험
• 높은 재현성이 필요한 연구 또는 논문 게재를 목표로 하는 경우

실무적 권장사항

연구용이라 하더라도 최소한 다음 항목은 확인하는 것이 좋습니다:

• 역가
• 무균성 / 마이코플라스마
• 엔도톡신
• 배치 간 일관성

한 줄 결론

비정제 AAV가 절대적으로 사용 불가능한 것은 아니지만, 매우 초기 단계의 거친 in vitro 검증에만 제한적으로 적합합니다. 기능 실험이나 in vivo 실험을 수행할 경우에는 정제된 AAV를 사용하는 것이 바람직합니다.