1. qPCR(정량 PCR)
원리:
- 바이러스 게놈 카피 수(vg, viral genome)를 검출. AAV 게놈의 특정 서열(보통 ITR 또는 전사 유전자)을 증폭하여 정량.
장점:
- 감도가 높아 낮은 적정값도 측정 가능
- 정량 정확도 및 재현성이 높음
- 감염성에 의존하지 않아 모든 혈청형에 사용 가능
단점:
- 감염성이 없는 ‘빈 캡시드’를 구분할 수 없음
- 고순도 DNA 추출 필요
적용:
- 생산 과정 모니터링
- 배치 간 게놈 함량 비교
2. ELISA(효소면역측정법)
원리:
- 특이 항체로 AAV 캡시드 단백질(VP1/VP2/VP3)을 인식하여 바이러스 입자 수(pp) 정량.
장점:
- 간단하고 빠름
- 바이러스 입자 총수를 직접 측정 가능
- 세포 감염 불필요
단점:
- 빈 캡시드와 감염성 바이러스 구분 불가
- 혈청형별 특이 항체 필요
적용:
- 바이러스 총량 개략 측정
- qPCR과 병행하여 패키징 효율(vg/pp 비율) 평가
3. 감염성 적정(Titer / Transduction Assay)
원리:
- 세포 또는 동물 모델에 감염시켜 바이러스 감염 능력 평가(예: 형광 리포터 유전자 발현).
장점:
- 실제 감염 능력 반영
- 배치 간 기능 차이 평가 가능
단점:
- 시간 소요(2~3일)
- 세포 유형 및 감염 조건에 의존
적용:
- 기능성 확인
- 생산 공정 최적화
4. 전자현미경(EM)
원리:
- 바이러스 입자를 직접 관찰하고 개수를 카운트.
장점:
- 입자를 직접 시각화
- 완전 입자와 빈 캡시드 구분 가능
단점:
- 고가, 조작 난이도 높음
- 다수 샘플 측정에는 부적합
적용:
- 바이러스 입자 구조 분석
- 고급 연구 또는 산업 공정 검증
5. 기타 방법
| 방법 | 원리 | 특징 |
| SDS-PAGE / Western blot | 캡시드 단백질 검출 | VP1/VP2/VP3 비율 평가, 반정량적 |
| PicoGreen / DNA 형광염색 | 형광 염료로 바이러스 DNA 검출 | 빠르지만 감도 중간, 간섭물 영향 있음 |
정리
| 방법 | 측정 대상 | 장점 | 단점 | 용도 |
| qPCR | 바이러스 게놈(vg) | 높은 감도, 재현성 | 빈 캡시드 구분 불가 | 배치 비교, 공정 관리 |
| ELISA | 캡시드 입자(pp) | 간편, 빠름 | 빈 캡시드 구분 불가 | 총 입자 수 개략 측정 |
| 감염성 적정 | 생물학적 활성 바이러스 | 기능성 반영 | 시간 소요, 조건 의존 | 기능 확인 |
| EM | 입자 시각화 | 빈 캡시드/완전 입자 구분 | 고가, 조작 난이도 높음 | 입자 분석 |
| SDS-PAGE/Western | VP 단백질 | 반정량, 비율 분석 | 정밀하지 않음, 시간 소요 | 캡시드 단백질 분석 |
추천: qPCR + ELISA로 총 입자 수와 게놈 수 평가 후 감염성 적정으로 기능 확인.
About PackGene
PackGene Biotech is a world-leading CRO and CDMO, excelling in AAV vectors, mRNA, plasmid DNA, and lentiviral vector solutions. Our comprehensive offerings span from vector design and construction to AAV, lentivirus, and mRNA services. With a sharp focus on early-stage drug discovery, preclinical development, and cell and gene therapy trials, we deliver cost-effective, dependable, and scalable production solutions. Leveraging our groundbreaking π-alpha 293 AAV high-yield platform, we amplify AAV production by up to 10-fold, yielding up to 1e+17vg per batch to meet diverse commercial and clinical project needs. Moreover, our tailored mRNA and LNP products and services cater to every stage of drug and vaccine development, from research to GMP production, providing a seamless, end-to-end solution.